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AI直播 :生物学领域也有DALL-E 2 模型:大卫·贝克用AI为蛋白质生成精确设计

幕言助手 2024-04-28 04:18:25 幕言直播助手 936 ℃ 阿比整蛊源头|厂商微信:gogoh6
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最近,我们看到像 OpenAIDALL-E2这样的文本到图像的人工智能扇窗模型不断涌现AI直播 。它们经过“特殊”训练,可以生成几乎任何你想要的图片,无论是怪异的,还是美丽的。由于表现亮眼,这些模型在时尚、电影制作等创意另一行业掀起智能蛋白质了不小的热潮。

鲜为人知的是,这些项目背后的技术,同样也能AI应用生成在生物技术实验室ai中,而且潜力巨大AI直播

这种技术被称为扩散模型(diffusion model),许多实验室已经开始使用这种生成式人工智能技术,尝试设计自然界中生物医药游戏从未出现过的新型生物蛋白质AI直播

(来源生物:STEPHANIE ARNETT/MITTR; ENVATO,ai课是直播吗, ALPHAFOLD)

近日,有两个实验室先后宣布了生物技术各自的新项目,ai打开生物学研究,都是使用扩散模型来设计精确程度发展比以往任何时候都高的新蛋白质AI直播

总部位于波士顿的初创设计公司 Generate Biomedicines 公布蛋白质了一个名为 Chroma 的项目,该公司称其为“生物学领域的 DALL-E 2 模型”AI直播

与此同时,由攻破蛋白质生物学家大卫·贝克系统(David Baker)领导的华盛顿大学团队也成立了ai一个类似的项目,叫做 RoseTTAFold DiffusionAI直播

在最近发布系统的一篇预印本论文中,贝克和他的同事们表明,他们的模型另一可以为新的蛋白质生成精确的设计,然后在实验室中实现AI直播

RoseTTAFold 的联合进军开发者之一布莱恩模型·特里佩(Brian Trippe)说:“我们生成的蛋白质与现有的蛋白质几乎没有相似之处AI直播 。”

这些蛋白质生成器可以直接用于设计具有特定特性的蛋白质,譬如指定解构的形状、大小或生物技术功能AI直播

实际上,这使得根据特定的任务来制作新的蛋白质成为可能AI直播 。研究人员希望,这将最终模型帮助开发新的、更有效直播的药物。

“用数百万年进化得到的东西,我们可以在几分钟内发现,” Generate Biomedicines 的首席技术官盖沃格·格里戈里扬(Gevorg Grigoryan)说道AI直播

位于美国马萨诸塞州的微软研究院的生物物理学家艾娃·阿米尼(Ava Amini)认为,这项工作最值得注意的一点是,可以根据“想要的限制条件来生成蛋白质”AI直播

(来源:GENERATE BIOMEDICINES)

蛋白质设计是生命系统的基石AI直播 。在动物身上,它们控制着生物技术消化食物、收缩肌肉、探测光线、驱动免疫系统等等。当人们大卫生病时,蛋白质直播也会起到一定的作用。

因此,蛋白质是药物生物学界开发的重点精确关注对象AI直播 。今天的许多最新药物,本身都是基于蛋白质的。

“大自然进军里的各种东西打开都在打开使用蛋白质,”格里戈里扬说,“用它提供DALL-E治疗干预的前景游戏真的很生物学界巨大模型AI直播 。”

但难题药物设计者目前只能使用由天然蛋白质组成的“设计列表”,而用计算机模型生成更多蛋白质的目标是,将这个列表扩展到几乎无限大AI直播

设计蛋白质的计算技术解构并不新鲜,但是以前计算的方法生成在设计大型蛋白质或蛋白质复合物方面进展缓慢AI直播 。蛋白质复合物可以被理解成研究,由多个蛋白质偶联在一起组成的分子机器,而这些蛋白质通常对治疗疾病至关重要。(来源模型:IAN C HAYDON / UW INSTITUTE FOR PROTEIN DESIGN)

(来源模型:IAN C HAYDON / UW INSTITUTE FOR PROTEIN DESIGN)

最近宣布的这两个项目,ai生物计算技术发展瓶颈,并非人们第一次生物医药尝试使用贝克扩散模型来生成蛋白质AI直播

在过去的几个月里,ai 生物学领域,由 Amini 等人开展的一系列研究表明,扩散模型是一种很有前途的技术,但他们都属于概念验证是什么的原型AI直播

Chroma 和 RoseTTAFold Diffusion 则是建立在这些研究成果的基础上,他们是第一个成熟的、可以产生各种精确设计的蛋白质的程序AI直播

南拉塔·阿南德(Namrata Anand)在 2022 年贝克 5 月共同开发了蛋白质生成的第一个扩散模型,他认为 Chroma 和 RoseTTAFold Diffusion 的重要意义在于他们采用了这项技术并扩大了它也有,使其能在更多的数据和计算机上进行训练AI直播

她说:“这开始大卫越来越像攻破 DALL-E,AI生物技术,AI智能直播,因为他们已经扩大了规模AI直播 。”扩散模型是经过训练的神经网络,可以从输入中去除数据中的随机干扰,也就是所谓的“噪声”。给定随机的像素点,扩散模型可以将其变成可识别的图像。

在 Chroma 中,ai技术在生物医药领域,噪声是通过解开由蛋白质组成领域的氨基酸链而添加的AI直播 。给定这些链的随机簇,Chroma 会试图将它们放在一起形成一种蛋白质。

在对结果的特定解构课约束的指导下,ai 生物,直播 ai,Chroma 可以生物医药生成具有特定特性发展的新蛋白质AI直播

贝克的团队则采用了一种不同的方法,尽管最终的结果是相似的AI直播 。该团队的扩散模型从一个更混乱的结构开始。

另一个关键的区别是,RoseTTAFold Diffusion 利用了关于蛋白质片段如何结合扇窗设计的信息,该信息由一个单独的、被训练来预测蛋白质结构的神经网络提供(就像是 DeepMind的AlphaFold所做的那样)、它指导了整个蛋白质生成过程AI直播

Generate Biomedicines 和贝克的团队都展示了一系列令人课印象深刻的成果AI直播 。他们能够产生具有多种对称生成性的也有蛋白质,包括圆形精确、三角形、六边形的蛋白质。

为了证明其程序的多功能性,Generate Biomedicines 生成了形状像 26 个攻破拉丁字母和数字 0 到 10 的蛋白质AI直播 。这两个瓶颈团队发展还可以生成蛋白质片段,将新的部分与现有的结构相匹配。

这些演示中展示的蛋白质结构在实践中没有任何作用AI直播 。但是,因为蛋白质生成的功能是由其形状决定的,所以能够根据需要产生不同的结构是至关重要生物医药的。

在电脑上产生奇怪的设计是一回事,ai生物游戏新浪,而把这些设计变成真正的蛋白质则是另领域一回事,后者才是最终目标AI直播

Generate Biomedicines 提取了一些设计的序列,去组成蛋白质的发展氨基酸串,AI直播 :生物学领域也有DALL-E 2 模型:大卫·贝克用AI为蛋白质生成精确设计,并新浪通过另一个人工智能程序技术执行AI直播

他们发现,ai进军生物学界,其中 55% 的蛋白质被预测会折叠成瓶颈由 Chroma 产生的结构,这表明这些解构设计蛋白质设计是可行的AI直播

贝克的团队也进行了类似的测试也有,他们在评估其模型方面比 Generate Biomedicines 做得更多AI直播

他们在实验室里制造了一些 RoseTTAFold Diffusion 的设计AI直播 。对此,Generate Biomedicines 公司表示计算,它也在进行实验室测试AI,但还没有技术准备好公开结果。

“这生物科技不仅仅是概念的证明,ai解构生物学,”特里普说,“我们实际上是在用它来是什么制造非常好的蛋白质AI直播 。”

对贝克贝克来说,最重要的DALL-E结果之一是产生了一种新的DALL-E蛋白质,AI直播是什么,它可以附着在甲状旁腺激素上,这种激素控制着血液中的钙水平AI直播

他说:“我们基本上只将甲状旁腺激素作为了模型的输入,ai与生物科技,而没有其他东西,生物与ai结合,然后告诉它制造一种可以与该激素结合智能生物学的蛋白质AI直播 。”

当在实验室里测试这种新蛋白质时,他们发现它与激素的结合比使用其他计算方法产生的任何蛋白质都打开更紧密也有,而且也比现有的药物研究更紧密AI直播 。贝克说:“我们的模型是凭空想出这种生物学蛋白质设计的。”

格里戈里扬承认,发明扇窗新蛋白质只能算是第一步生物科技AI直播 。“我们是生物学界一家制药公司,”他说,“本质上DALL-E,我们最关心的是能否制造出有效研究的药物。”

以蛋白质为基础的药物首先需要通过量技术产这一关,然后在实验室中进行测试,最后才能在人体上进行测试AI直播 。这可能需要数年时间。但他认为,他的公司和其他人会生物技术找到加快瓶颈这些技术步骤的办法。

贝克说ai:“虽然科学的进步是断断续续的,但现在的我们正处于一场所谓的‘技术革命’之中AI直播 。”

支持:Ren

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